郑远海在法国勤奋地学习着，也不时受到某些外国同学的歧视，当一名英国中校学员大肆吹嘘当年他们的皇家海军前辈曾浪漫地到过东方时，郑远海义正词严地谴责了所谓浪漫的东方之旅不过是一此野蛮的掠夺和强盗行经。使很多外国同学了解了历史真相。

　　谢庭群擅自把鲁淮成的家具给换了，他的能说会道引起了鲁淮成的反感，第二天他拿出自己的钱交给了营房处长。

　　鲁淮成来到基地医院例行检查身身体，无意间看见梅杏儿，他们认出了对方，鲁淮成惊讶地看着当年的放羊女，如今成了海军战士，倍感欣慰。

　　于季东为了能跟秦思婷在一起，毅然把自己公司从中南搬到了东江。可谓用心良苦，但秦思婷心里却深藏着郑远海。

《旗舰》分集介绍：第十二集

　　谢庭群把南克江请到酒馆，声言自己也喜欢秀竹，可以跟他一起展开追求，最后秀竹如果愿意跟谁，她就是谁的，然后举杯豪赌，南克江赌气地跟他干起杯来，结果大醉，在支队紧急集合时，竟然没有到位。

　　谢庭群还假传圣旨，支队最后无奈地决定把南克江调离潜艇，到了远离东江的菊花岛的一个观通站工作。

　　秀竹哭着不让南克江离去，但倔强的南克江不原谅自己因为醉酒，耽误了紧急集合，他决心卧薪尝胆，毫无怨言地去了菊花岛。

　　鲁淮成突击考察潜艇支队，但由于谢庭群的通风报信，支队干部全部到位迎接，在招待所的饭桌上，谢庭群擅自点了八个菜，这一切使鲁淮成大为恼火，他严厉批评谢庭群，警告他要注意自己的身份，他只是工作秘书，不是生活秘书。

　　梅杏儿例行给鲁淮成量血压，鲁淮成觉得梅杏儿有些象自己失散的女儿，梅杏儿告诉鲁淮成如果想女儿了，就叫她来。鲁淮成高兴的答应了。

　　186的舰长人选迫在眉睫，陈建军是第一人选，呼声最高。

　　谢庭群嘱咐他最近一定要谨慎小心，不要出纰漏。

《旗舰》分集介绍：第十三集

　　基地为了考核舰长人选，组织了海上攻潜训练。陈建军代行舰长职务，指挥这次演练。就在攻潜行动中，突然一艘不明国籍潜艇潜入了我方对外宣布训练戒严的海域进行侦察，基地命令180舰前往追击拦截，陈建军以为是鲁淮成考验自己，不相信真有不明潜艇的进入，为了在舰长考核中不出问题，安全起见，没有抄有礁石危险的近海追击，贻误了战机，致使不明潜艇逃出我舰的包围。

　　父亲陈敬国闻听这次陈建军的失误，大怒，他严厉批评他没有实战观念。

　　鲁淮成认为陈建军的这次失误是不可饶恕的，认为186舰长不能由他担任，起码现在不合适，在政委王宏业召集的基地党组会上，鲁淮成没有举手，但陈建军的舰长人选还是以少数服从多数地通过了。陈建军如愿以尝地当上了186旗舰的舰长。

　　在菊花岛上，南克江为救一落水女青年，挺身而出，基地接到当地群众寄来的表扬照片，但被谢庭群截住扣压，并经过裁剪拿到了秀竹面前，诬蔑南克江在菊花岛偷情被人检举，秀竹惊讶和痛苦的与南克江断绝了关系。

　　186舰奉命出访六国，鲁淮成亲自带舰出访，秦思婷和梅杏儿随舰保健。

　　186舰代表中国海军出访，所到国家，受到了外国军方和海外华侨的热情欢迎。