此时义仲和行家带领的军队入住了京都，比仍然身在镰仓的赖朝更早入京，让义仲坚信自己可以成为源家的首领，不禁欣喜若狂。义仲等人打算入宫拜见法皇。

　　平家在前往西国途中留宿福原，时子恍惚之间看到了清盛的幻影，结果第二天平家把自己一手建立起来的福原付之一炬，平清盛最爱的“梦之都”最终化为一片灰烬。

　　另一方面，得到法皇正式授予高官的义仲，和妻子巴沉溺在奢靡的生活中。义经派密探入京打探，得知义仲的军队在京都穷尽极奢，于是他不顾牟庆的劝阻，决定亲自上京劝说自己的堂兄弟义仲改过。

《义经》分集介绍：第二十四集 动乱的京都

　　义经来到京都后，单独亲自前往拜访义仲。但义仲根本不肯听他这些话，于是义经只好失望地离去，途中被巴袭击，实际上这是义仲默许的。

　　朝廷内部对义仲的不满之声日益高涨，于是后白河法皇决定利用和他有血缘关系的源行家来牵制义仲。

　　此时回到近江的义经意外地遇到了平赖盛（三浦浩一饰），原来赖盛认为平家之所有有今天，都是自己的母亲推波助澜所致，于是他决心和平家断绝关系。而义经则烦恼要不要向赖朝报告义仲现在的情况。

　　法皇命令源行家带兵围剿平家，却一瞬间就战败而逃，这让原本打算利用行家牵制义仲的法皇感到很不安，于是派自己的心腹平知康（草刘正雄饰）去服侍义仲，谁知知康却遭到义仲当众羞辱，法皇愤怒之余，秘密训练僧兵打算用以对抗义仲的军队。得知此事认为法皇背叛自己的义仲，带兵袭击在法住寺大殿的法皇，并将其软禁了起来。

《义经》分集介绍：第二十五集 义仲的末日

　　义经受命为勤王之师上京讨伐义仲，这是义经第一次带军，幸亏身边有牟庆等能人无数，加上义经本身的军事天才，很快救出了被义仲软禁的后白河法皇。

　　义仲带军逃往镰仓，然而此时他只有四千兵马了。他原本希望自己的叔父行方能帮忙，可惜得知行方认为他这是叛国，反而带军前往京都打算剿灭义仲。终于醒悟自己已经大势已去的义仲，让妻子巴带一部分人离开，这样分开走可以分散敌人的注意力，结果义仲在镰仓去世。

　　义经被法皇受命为皇宫的护卫统领，开始在京都正式落脚。某天行家来拜访义经，并大声数落义仲的不是，义经勃然大怒，但同时又对在没有战争的情况下居然投身家族之争的自己生气。

　　此时，在好友吉次的帮助下，义经终于和自己的母亲常盘重逢，但常盘却告诉义经，不要再来见自己了，虽然对母亲的话感到疑惑，但义经还是答应了。