故事便由此展开。高仓奏被美国警方暂时除名，而日本警方却把他编入了特别搜查课与丸尾组成了搭档（最差最强的搭档华丽登场），与此同时，由岐被形同软禁的生活折磨得时发恶梦，丸尾不忍之下经由高仓奏同意，三人陪同由岐外出购物，事后被医生告知由岐情绪好转有可能恢复记忆，但紧接着在堀川带由岐出门时在电梯遇到混混棚岛秀夫（成宫宽贵饰），俩人被劫为人质。在追捕棚岛秀夫解救人质的过程中，出现一名神秘墨镜男，致使由岐因看见棚岛秀夫差点想起往事的苗头熄灭，而自知纵使躲过警察追捕也难逃组织罪责的棚岛秀夫自杀身亡。棚岛秀夫的死和神秘墨镜男的出现，是线索的承接作用，同时也证明了高仓的判断——由岐肯定与此组织有关系。恐怕后者也不是高仓所要找的枪疤男真凶。但墨镜男又是何许人也，敬请期待第二话。

　　在此特别要说明的是，高仓奏认为罪犯头目左手腕处有很大的枪伤疤痕，而此人也是高仓奏杀父之仇人（罪犯头目的伤痕是由高仓奏当警察的父亲所致，也是唯一让罪犯受伤的警察，被该名罪犯所杀）。

《东京DOGS》分集介绍：第二话

　　为安全计，高仓和工藤决定为由岐搬家，并且俩人搬来与由岐同住，同时，律师小宫山义彦（杉本哲太 饰）遭到枪袭，保护其和儿子小宫山宏辅的任务落在了高仓和工藤的肩上（小林海人 饰），二人再次决定让宏辅和由岐住在一起，于是发生了一系列搞笑又温情的场面：众人陪宏辅玩游戏玩到累趴，宏辅与高仓关于父子之间的对话，一起去学校寻找宏辅，在犯罪分子枪口下救下宏辅，宏辅最后对父亲的理解……

　　枪袭小宫山的凶手其实是小宫山合作多年的客户建设会社的社长柴田雄三（佐佐木胜彦 饰）所指使，与凶手一起被逮捕归案。与此同时，本剧主线之一的由岐失去的记忆，因枪袭小宫山凶手的出现再次有了复活的迹象，由此可以推测柴田雄三或许与高仓所查找的组织有某种联系，谜案开始被层层剥开，真相会越来越接近。

　　另一方面，根据医生的建议，为使由岐尽快恢复记忆，高仓和工藤安排堀川陪同由岐在一家店里工作，但是新来的另一位店员让高仓直觉可疑，四目相对之间，是为设悬。

　　本集搞笑看点：高仓与工藤之间关于饺子的对话，二者在三陪俱乐部表现出迥异的行事风格，工藤对由岐记忆线索的草木皆兵，东干久饰演的益子礼二一贯的吐槽风格，笑料爆出，令人捧腹。

　　本集精彩亮点：片尾惊艳，MV风格的拍摄让整个片尾充满了唯美、浪漫的气质，观之不禁怦然心动，注目良久。

《东京DOGS》分集介绍：第三话

　　剧情依然分两条线索展开。高仓和工藤在一家餐馆逮捕了前来闹事的流氓，但逃脱的一名罪犯在第二天遭到了枪杀。二人着手调查此案，却发现工藤视为兄弟的好友蒲田重雄嫌疑最大，工藤一时难以接受，他坚信自己的朋友是清白的，并与高仓产生分歧。工藤独自赴阿重之约，却被下套围攻，高仓及时赶到解围。随着调查的深入，却发现系工藤以前暴走族时的前辈木内所为，并嫁祸于小茂。追捕现场，工藤痛心不已并劝木内别再让家人看到他逃跑的样子，高仓向仓皇逃窜的木内开枪。