《三宝医馆/医神》分集介绍：第25集

　　骆亲王带着崔浩微服来到金陵。路上得知三宝在民间声望极高，崔浩提起三宝和温柔的关系，骆亲王称此人一定要铲除。这天趁三宝出诊，崔浩找到温柔和冬儿，冬儿忙叫温柔快走，与凶手打成一团。秦妙荷听到外面的打闹声，冲出来，看见崔浩认出他就是杀死父亲的凶手，与冬儿连手打崔浩，反被崔打倒在地。梁挺赶到，与崔相搏，三宝赶回来，崔浩不敌逃走。秦回到家中，见母亲已被崔杀死，秦与崔浩打斗，三宝，梁挺赶来一起出手，秦妙荷杀了崔浩。

《三宝医馆/医神》分集介绍：第26集

　　叶展鹏在京城被通缉，叫人捎来一封信，众人得知他在京城处境艰难，翩翩要上京与他共渡难关，冬儿也决定带温柔去找叶展鹏。三宝将温柔留下，并要冬儿与翩翩、小兰结伴同行，由冯苏送三人出金陵。在路上，翩翩一行遇到四名杀手，冬儿为救翩翩等人自己中剑而死。翩翩来京数日也没有叶展鹏的下落，最后在一郎中的指引下，他们在胡同中见到叶展鹏，叶听说冬儿去世，伤痛自责。

《三宝医馆/医神》分集介绍：第27集

　　梁挺被人陷害收藏官银，冯苏赶来告诉三宝，清兵就要来封医馆，三宝要冯苏带温柔躲避。清兵冲进来，三宝冲出重围，通天老祖出现，三宝被老祖毒针所伤，此时。冯苏和温柔被齐汗青软禁在回春堂药库。齐去见骆亲王，称自己已抓到温柔，要挟骆亲王以官位相换，骆亲王和齐翻脸。骆告诉通天老祖，杀一尘的凶手是齐汗青，并要老祖将温柔抓来。此时，温柔和冯苏从老鼠洞爬出逃走。秦妙荷照顾三宝，忽见镇远镖局的镖旗，决定找司马帮忙。秦与田明推着三宝跟在压镖队伍后出城，被老祖徒弟认出，秦推着三宝先跑。三宝醒来追问田明下落，得知田明走丢了。田明流落青石镇，路过温府，觉得此地熟悉，脑中闪过许多画面，终于明白自己是谁！

《三宝医馆/医神》分集介绍：第28集

　　秦妙荷与三宝在客栈住下，三宝怕自己连累秦，让她离开，其则表示会一直留在他身边。京城顾命大臣田继尧是骆亲王的死对头，叶展鹏决定向他禀明一切，第二天，叶展鹏挡住田继尧的官轿，讲出骆亲王是行刺皇上的主谋。骆亲王派清兵前来，称叶为朝廷的钦犯，叶被押走。就在叶展鹏要被处斩时，皇上的贴身太监传来圣旨：将叶展鹏带回田府，押候再审。叶被带进田府，见到田明。田明讲出，他爹就是田继尧，会接办此案，揭发骆亲王的罪证。

　　秦妙荷带三宝返回法华寺，三宝叫秦妙荷下山打点日常用品，自己则来到师傅圆寂的山洞……

《三宝医馆/医神》分集介绍：第29集

　　梁挺一人赶上山来，巧遇采购归来的秦妙荷，冯苏称师傅可能有意支开荷姐，众人感到不妙，急忙上山，荷姐在房中看到三宝留的信，温柔说出三宝曾带她去过师傅圆寂的山洞，众人赶往，看到正在练功的三宝，得知他创出一套拳法，可将体内毒素排出。京城，田明提出先回金陵，看看三宝，或许会有意外收获。骆亲王吩咐跟踪叶等人，一旦找出白秀夫，就先杀之灭口。叶等人回到金陵，被通天老祖拦截。老祖将翩翩带走，为他治疗头痛。叶展鹏赶到法华寺，告诉三宝，通天老祖要以“麻黄散”交换翩翩，并提出与三宝决斗，三宝答应。齐汗青从众多卷宗中推测出白秀夫是青城派的人。齐汗青抓来三十个可疑的人，称只要抓住温柔就可指认白秀夫。夜，齐带人将温柔和秦掳走。秦被施以毒刑，温柔被逼开口，假意说曾和爷爷在茶寮里见过白秀夫，齐汗青带温柔、秦妙荷赶到茶寮却空无一人，就在齐要对秦动刑之际，三宝出现，齐汗青逃走。

《三宝医馆/医神》分集介绍：第30集（大结局）

　　通天老祖掳走小兰、温柔、翩翩和秦妙荷，三宝等人愤怒，决心迎战老祖。决战之日，众人联手，老祖毫无招架之力。提督府内正在审讯温府血案，温柔、叶展鹏、三宝前来求见，温柔从众人中认出白秀夫，白道出实情……，时，皇上手谕到：骆亲王与提督大人密谋造反，立即拿下……。白秀夫找出所有证据交给田明，并愿意作证，指证骆亲王。回春堂内，齐汗青要翩翩跟他远走高飞，翩翩斥骂其不知廉耻，叶展鹏进来，齐与叶展开决战，齐汗青被杀。

　　医馆重新开张，三宝与秦妙为翩翩和叶展鹏、小兰和梁挺两对新人做主婚人，冯苏讲出今天三喜临门，还差一喜！众人逼三宝向荷姐求婚，两人心照不宣，答应了。众人开心不已。